1、植物病虫害对秸秆饲料及对草饲家畜的危害玉米青枯病，连作玉米田及高湿、雨后骤晴的情况下发病严重，病菌从根部伤口侵入，使叶片呈灰绿色，萎蔫下垂，并逐渐变黄，根、茎基部呈水渍状后变褐腐烂，潮湿时可见白色或粉红色菌丝。小麦纹枯病、小麦锈病、麦圆红蜘蛛等病虫害都对秸秆有害，使秸秆都带病菌和病毒。这些带病菌的秸秆直接饲喂家畜会造成很大的危害。如牛的感光过敏病就是因为采食了大量的致病植物引起的。该病以动物皮肤的无色素部分发生红斑和皮炎为特征，重症家畜可见体温升高，食欲减少，皮肤充血肿胀，形成水泡、脓疮，破溃后流出淡黄色液体而感染化脓，直至皮肤坏死脱落。
2、秸秆本身有毒和霉变引起的家畜中毒鲜嫩高粱、玉米秸秆苗和亚麻叶等含氰苷的植物被单胃家畜采食后，可引起 不良后果。还有些植物具有天然有害物质，如高粱秸秆中的单宁酸和一些植物性原料中的生物碱、游离棉酚、蛋白酶抑制剂等，植酸以及有毒硝基化合物等。这些植物秸秆直接饲喂家畜一定要注意安全适量。
3、解决办法。好旺农秸秆发酵剂可以解决上述问题。利用秸秆发酵剂对秸秆进行发酵处理，可以达到杀菌杀毒的作用。发酵剂中的有效菌种，在适宜环境下大量繁殖，分解秸秆的同时产生的热量可以是物料达到50—60度高温。在这样的温度下持续几天，秸秆中的病毒、虫卵等均被杀死，家畜可安全食用。另外，用秸秆发酵剂处理秸秆，具有发酵速度快、操作简单、无需辅料即可将各种农作物秸秆转化为高质量饲料等特点。发酵好的饲料呈酒香气，适口性极好，营养成份大大增高，能使畜禽生长速度加快，是广大养殖户降本增效，提高经济效益的好帮手。
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秸秆饲料的营养特点是粗纤维含量高，占干物质的30%~40%，木质素、半纤维素、硅酸盐含量高，而且纤维素、半纤维素和木质素结合紧密，质地粗硬，适口性差，消化率低。一般每千克秸秆饲料的消化能在7.78兆焦~10.4兆焦之间，粗蛋白质含量低，豆科秸秆为8.9%~9.6%；禾本科为4.2%~6.3%。粗脂肪含量较少为1.3%~1.8%。矿物质含最低，缺乏动物生长所必需的钻、铜、硫、硒和碘等元素，钙和磷的含量也低于羊的营养水平。维生素含量严重缺乏，特别是羊生长所需的维生素A、维生素D和维生素E等。秸秆饲料虽有许多不足之处，但经过加工调制后，营养价值和适口性得到提高，仍是羊冬季补饲的主要饲料。
秸秆养羊多采用舍饲喂养，可以根据羊的不同生理阶段，进行科学的饲养管理，以达到降低生产成本，提高经济效益，获取更多畜产品的目的。现将加工处理后秸秆的喂羊效果摘选如下，供养殖场户参考。
青贮饲料饲养山羊
据报道，利用“好旺农青饲料发酵剂”发酵秸秆饲养山羊试验（青贮玉米秸55%，精料45%，另加占日粮1%的矿维添加剂）、结果表明，羊平均日增重135克，月平均增重4.01千克，最高6.7千克，每只羊净增（2个月育肥期）产值8元~12元。
微贮玉米秸喂羔羊
据报道，选用40只小尾寒羊和宁夏滩羊的杂交羔羊，随机分成试验组和对照组，试验组用微贮玉米秸秆，对照组用未处理的玉米秸秆，两组混合精料比例和喂量相同。精料比例为玉米粉40%、麦麸20%、豌豆40%，饲喂量每只每天限量135克，经30天试验，试验组羔羊平均日增重323.3克，比对照组193.3克多130克，提高了67.3%（P＜0.01），试验组平均每千克增重成本比对照组降低21%，提高效益71.4%。
好旺农青饲料发酵剂发酵秸秆饲喂肉绵羊
据报道，选用体重平均为36.5千克的夏洛来等肉羊品种的杂交一代育成羊30只，随机分成3组，试验一组按每100千克风干日粮加0.45千克中草药促生长素，试验二组按每100千克风干日粮添加EM菌发酵料10千克，试验三组为对照组，饲喂基础日粮。基础日粮的组成和配比为精饲料由玉米、豆饼、尿素、盐组成，占日粮的24%，玉米秸秆草粉占日粮的76%。经过90天的试验表明，三组的全期总增重分别达到66千克、62千克、53千克、平均日增重分别为81.48克、76.54克、72.70克，分别比对照组提高12.07%、5.28%。本试验EM发酵秸秆只占饲料秸秆量的10%作为添加剂来应用，如能全部将秸秆发酵饲喂，效果一定会更好。
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